انگشت نگاری تعدادی از ژنوتیپ های برنج با استفاده از نشانگر های مولکولی aflp

برنج غذای عمده و منبع اصلی کربوهیدرات برای بیش از یک سوم از جمعیت جهان است. این گیاه همچنین جزء غذاهای اصلی مردم ایران محسوب می­شود. در این پژوهش به منظور ارزیابی و انگشت­نگاری تعدادی ژرم­پلاسم برنج کشور که شامل 28 رقم محلی و 19 رقم خارجی بوده است، از نشانگرهای مولکولی aflp استفاده گردید. با استفاده از 10 ترکیب آغازگر، تعداد 675 نوار (باند) به دست آمد که تعداد 429 نوار ­(5/63%) چندشکلی نشان دادند. از بین آغازگرهای مورد استفاده، ترکیب آغازگر، e-ttg و m-cat با 107 نوار بیشترین تعداد نوار و ترکیب آغازگر، e-agg  و m-ctg با 34 نوار کمترین تعداد نوار را تولید نمودند. مقدار متوسط محتوای اطلاعات چند­شکل (pic) نیز در این تحقیق 34/0 برآورد گردید. بهترین ترکیب آغازگرها برای تفکیک بهتر نمونه­های برنج نیز e-ttg و  m-cat با شاخص نشانگر 1/24 تشخیص داده شد. میانگین شباهت ژنتیکی بر پایه ضریب nei، 67/0 تخمین زده شد (97/0­40/0). دندروگرام به دست آمده با استفاده از روش upgma، سه گروه اصلی را بین ارقام مورد بررسی مشخص نمود که با نتایج حاصل از تجزیه و تحلیل pca نیز هم خوانی داشت. در این تحقیق نشانگر aflp توانست اثرانگشت منحصر به فردی را برای تمامی ارقام ایجاد کند. با توجه به شناسایی گروه­های هتروتیک، نتایج حاصل از این تحقیق می­تواند در برنامه های اصلاحی جهت تولید ارقام هیبرید و امید­بخش استفاده قرار گیرد.